Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc2Q3SXD3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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