Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp8Q2V6D6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms