Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171bQ14CH0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms