Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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