Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rpusd3Q14AI6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms