Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli2Q0VGT2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms