Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2b3Q0VF55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp2b3Q0VF55 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms