Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2bQ0KL01 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms