Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc21bQ0HA38 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms