Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf541Q0GGX2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms