Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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