Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms