Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnn2Q08093 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnn2Q08093 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms