Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MestQ07646 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MestQ07646 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MestQ07646 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms