Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdx4Q07424 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdx4Q07424 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms