Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah1bQ06985 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms