Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms