Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms