Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprgQ05909 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms