Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs3Q05895 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Thbs3Q05895 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Thbs3Q05895 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Thbs3Q05895 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Thbs3Q05895 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Thbs3Q05895 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Thbs3Q05895 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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