Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms