Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms