Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms