Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcad1Q04692 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms