Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd1Q04519 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms