Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnd1Q03719 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms