Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms