Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms