Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms