Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GscQ02591 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GscQ02591 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms