Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms