Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnb1Q02248 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms