Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms