Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms