Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms