Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms