Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms