Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms