Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Serpina1cQ00896 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms