Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VegfaQ00731 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms