Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms