Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms