Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VldlrP98156 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms