Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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