Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms