Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms