Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nbr1P97432 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms