Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps45P97390 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps45P97390 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms