Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf1bP97358 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms