Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmsP97355 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmsP97355 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmsP97355 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmsP97355 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmsP97355 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmsP97355 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms